Kromě pravidelných hodnocení se věnujeme i speciálním tématům, jako je například internacionalizace nebo spolupráce s praxí. Výsledky těchto hodnocení nám pomáhají reagovat na aktuální výzvy ve vysokém školství.
Tematická hodnocení jsou realizována každoročně Radou pro vnitřní hodnocení MU a věnují se do hloubky cíleně zaměřeným tématům, které Rada pro vnitřních hodnocení MU určuje dle aktuálních potřeb a strategie univerzity. Smyslem tematického hodnocení je především komplexně popsat a zhodnotit dané téma napříč celou univerzitou a ve vzájemných souvislostech. Výstupy tematických hodnocení slouží jako podklad pro každoroční Dodatky, tak pro Zprávu o vnitřním hodnocení kvality, která je zpracovávána jednou za pět let.